卡特·塔卡克斯博士.D.
生物与环境科学系
文理学院
教育
耶鲁大学医学院博士后培养
Ph.D.达特茅斯医学院遗传学博士
M.S.达特茅斯学院生物学专业
研究兴趣
我们都是从单个受精卵开始我们的生命之旅的，这些受精卵分裂成数百万个后代细胞. 我们向复杂身体的转变是由基因表达的rna驱动的. 这些rna充当指令，告诉细胞去哪里，以及变成什么.g. 大脑、皮肤). 我的研究兴趣在于了解细胞如何调节RNA活性. 研究表明，RNA稳定性的精确调控对健康发育至关重要, 导致以下问题. 细胞如何移除先前的rna以启动新的发育基因程序? 胚胎中的细胞因子决定了RNA存在的时间? 最后, 不同rna的产生和/或去除如何影响细胞分裂的决定, 移动, 或者变成一种特定的细胞类型? 要回答这些问题, 我的实验室利用斑马鱼模型系统来研究RNA调控在早期发育和大脑形态发生中的作用.
为什么斑马鱼? 斑马鱼正在成为一种非常受欢迎的模式生物，几乎可以研究细胞和发育生物学的各个方面. 斑马鱼可以在一个早晨产生数百个胚胎，这些胚胎很容易收集和研究. 胚胎发育迅速，透明, 允许细胞过程的实时成像. 除了, 基因组测序, 还有很多基因工具, 比如基于crispr的基因组编辑, 在这种模式生物中工作得非常好. 在我的实验室, 我们将这些工具与生化技术和显微镜相结合，以了解基因调控如何塑造生物形态. 最终, 我们希望从这项工作中获得的见解将有助于我们对人类健康和疾病的理解.
选定的出版物
塔·Kushawah, Luis Hernandez-Huertas, 华金·阿布加塔斯-努涅斯·德尔普拉多, 胡安Martinez-Morales, 米歇尔•德沃尔, Huzaifa哈桑, Ismael Moreno-Sanchez, 劳拉Tomas-Gallardo, 亚历杭德罗Diaz-Moscoso, Dahiana孟淑娟, 哈维尔Guelfo, 威廉Theune, Emry布兰南, 魏王, 蒂莫西卡宾, 安德里亚·莫兰, Alejandro Sanchez Alvarado, 爱德华Malaga-Trillo, 卡特米. 塔卡克斯， Ariel Bazzini, Miguel Moreno-Mateos. CRISPR-Cas13d在动物胚胎中诱导有效的mRNA敲低. 细胞发育. 2020 Sept 28; 54(6): 805-817 (封面文章)
Charles E Vejnar*， Mario Abdel Messih*， 卡特米. 塔卡克斯*瓦Yartseva, 帕诺斯Oikonomou, 罗曼global, 马龙Stoeckius, 斯蒂芬妮·刘, 米勒·李, Jean-Denis Beaudoin, 一Musaev, Hiba Darwich-Codore, 托拜厄斯·C·沃尔特, 赛义德Tavazoie, 丹尼尔Cifuentes, 安东尼奥·吉拉尔德斯. 斑马鱼母-合子转化过程中调节mRNA稳定性的3 ' UTR序列元件和蛋白的全基因组分析. 基因组研究. 2019年7月29日(7):1100-1114 *平等的贡献
Mohamed A El-Brolosy说, 撒迦利亚Kontarakis, 安德里亚·罗西, Carsten Kuenne, 斯蒂芬·哈, 娜娜福田, Khrievono Kikhi, 朱利亚·LM·博齐奥, 卡特米. 塔卡克斯，赖世磊，福田龙一，Claudia Gerri, 安东尼奥·吉拉尔德斯, Didier YR Stainier. 突变mRNA降解引发的遗传补偿. 自然. 2019年4月3日:193-197
Jean-Denis Beaudoin, Eva Novoa, Charles Vejnar, 瓦Yartseva， 卡特米. 塔卡克斯Manolis Kellis, Antonio J. 吉拉尔德茨. mRNA结构动力学分析鉴定胚胎基因调控程序. 自然结构 & 分子生物学. 2018年7月25日，677-686
瓦Yartseva *, 卡特米. 塔卡克斯*Charles Vejnar, miller T. 安东尼奥·李. 吉拉尔德茨. RESA以高分辨率识别mrna调控序列. 自然方法. 2017年2月14日(2):201-207 *平等的贡献
卡特米. 塔卡克斯 和安东尼奥·J. 吉拉尔德茨. miR-430调节神经管发育过程中的定向细胞分裂. 发育生物学. 2015年11月:1606(15):302025.
米莱尔T. 李，阿什利R. 邦, 卡特米. 塔卡克斯艾瑞尔·A. 凯特·R·巴齐尼著. 伊丽莎白·迪维托. 弗莱明和安东尼奥. 吉拉尔德茨. Nanog, Pou5f1和SoxB1在母体到合子的转变过程中激活合子基因的表达. 自然. 2013 Nov 21 503(7476):360-4.
卡特米. 塔卡克斯 还有安东尼奥·吉拉尔德斯. 作为基因雕刻家的microrna:寻找线索. 细胞与发育生物学研讨会. 2010 Sept 21(7): 760-767.
哈西娜·本切巴纳，爱德华·G. 休斯 卡特米. 塔卡克斯——杰森·R. Baird和Yashi Ahmed. 大肠腺瘤性息肉病的存在接近对无翅形态原的准确分级反应所需的最低水平. 发展. 2008年3月:135:963-971. (封面文章).
卡特米. 塔卡克斯——杰森·R. 爱德华·G·贝尔德. 塞拉·休斯. 肯特，哈西娜·本查巴内，白南准和亚什·艾哈迈德. 大肠腺瘤性息肉病无翼信号的双正、负调控. 科学. 2008年1月31日(5):336 - 336.
王军，帕万·K·卡纳提， 卡特米. 塔卡克斯，约瑟夫C. 科瓦尔斯基和基思. 德比郡. 染色体DNA转移 分枝杆菌smegmatis 是否与经典的Hfr染色体转移有机制上的不同. 分子微生物学. 2005 Oct . 58(1):280-8
卡特米. 塔卡克斯Gabrielle Amore, Robert D. Burke和凯文·J. 彼得森. 顶端外胚层NK2同源结构域基因的表达为早期海胆胚胎开辟了新的领域. 发育生物学. 2004年5月，269(1):152-64.
凯文·J. 杰西卡·彼得森. 里昂，克里斯汀·S. 诺瓦克, 卡特米. 塔卡克斯，马修·J. 沃戈和马克A. McPeek. 用分子钟估计后生动物的分化时间. 美国国家科学院院刊. 2004年4月，21 (6):559 - 561.
卡特米. 塔卡克斯凡妮莎·N. 梅，还有凯文·彼得森. 测试脊索动物背神经系统和内质层的假定同源物:NK2的表达.1 (TTF-1)在橡子虫Ptychodera flava中的表达. 演变与发展. 2002年11月，4(6):405-17.